Não há repositórios diferentes para pacotes de desktop e de servidor (portanto, você pode instalar todos os componentes de servidor disponíveis em uma instalação de desktop). A diferença entre o suporte a desktops e servidores com um LTS é que os pacotes relacionados ao servidor são atualizados dois anos a mais. Então você não terá cinco anos de suporte para, por exemplo, Aplicativos do GNOME apenas porque você instalou a versão do servidor.