Se você reinstalar, ele será substituído. Você precisaria ter uma mídia de instalação do XP que executasse a descriptografia TrueCrypt no disco rígido antes de iniciar o software de instalação do XP para acessar a versão não criptografada do disco.
De a página do TrueCrypt no Disco de Recuperação é usada :
Note: Alternatively, if Windows is damaged (cannot start) and you need to repair it (or access files on it), you can avoid decrypting the system partition/drive by following these steps: Boot another operating system, run TrueCrypt, click Select Device, select the affected system partition, select System > Mount Without Pre-Boot Authentication, enter your pre-boot-authentication password and click OK. The partition will be mounted as a regular TrueCrypt volume (data will be on-the-fly decrypted/encrypted in RAM on access, as usual).
Este parece ser um bom lugar para começar a tentar recuperar a instalação existente.