Este é um bug conhecido: link
É muito chato, e em 11.10 você também não pode mudar para o LibreOffice via alt-tab - ele simplesmente não aparece. A instalação da "lo-menubar" não ajuda necessariamente, e de fato pode piorar as coisas, já que quando as aplicações maximizadas do LibreOffice não mostram sua própria barra de menu nem a barra de menu global, tornando impossível fechar a janela sem recorrer a atalhos do teclado.
Você pode reiniciar o Unity para uma correção muito temporária, mas, mais cedo ou mais tarde, isso acontecerá de novo, às vezes imediatamente.