Isso foi causado pelo fato de que a única linha no arquivo de configuração do linuxthreads era exit 0
(o que obviamente fez com que todo o script parasse como foi lido).
O que eu fiz foi alterar o conteúdo do linuxthreads para configurar o conteúdo da libidn:
libc_add_on_canonical=
libc_add_on_subdirs=.