Quando você cria ou edita um arquivo em uma unidade NTFS, ele recebe o usuário ou grupo atribuído a ele. A Microsoft explica esse mecanismo muito bem. Basicamente, cada arquivo recebe um grupo de domínio e um usuário atribuído. (DOMAIN \ user)
É claro que eles não falam sobre como funciona em profundidade, mas as pessoas que reconstruíram o ntfs-3g para linux tiveram que se aprofundar no sistema de arquivos para entender como ele funciona. Existe um artigo que explica como os usuários do Linux podem ser mapeados para os usuários do Windows para facilitar o fluxo de trabalho. Apesar de não estarmos falando sobre linux aqui, a informação que você pode ver é que os mapeamentos são um conjunto de números diferentes, por exemplo:
500::S-1-5-21-1833069642-4243175381-1340018762-1008
A parte na frente dos dois pontos é o ID do usuário linux, a parte depois disso é o ID do usuário do Windows, que é armazenado no campo proprietário. Embora o Windows obviamente não precise de um ID do usuário linux, ele terá uma tabela de mapeamento semelhante, mapeando os usuários do sistema em relação aos IDs armazenados no arquivo.
Quando você está vendo um arquivo agora no sistema correto que realmente tem esse proprietário, o Windows pode ler e identificar esse ID. Mas se você levar a unidade para outro computador, ela não poderá ser mapeada, simplesmente porque o proprietário dos arquivos não é conhecido pelo outro sistema.
(Eu estou apenas supondo aqui, mas para mim esta parece ser a razão)