Não é 100% claro para mim por que isso pode ter acontecido, mas sugiro que você execute chkdsk
para verificar se a sua unidade não foi corrompida. Alguns arquivos importantes que armazenam informações sobre suas bibliotecas podem ter sido afetados e isso pode estar causando a falha do Windows ao ler seu banco de dados de biblioteca (e também pode ter sido responsável pela gravação com falha na pasta).