Como você não especifica como está fazendo backup, é difícil dizer, mas supondo que esteja usando o tar, então sim, apenas adicione --exclude = / host ou, melhor ainda, use --one-file -sistema para evitar que recorra a outros pontos de montagem.
Eu estou fazendo o backup do Ubuntu e fui verificar como estava indo e notei que ele estava fazendo o backup do meu Windows também. Como faço para excluir o Windows durante o backup? Ele diz /host , então eu só faria --exclude=/host ?
EDITAR:
Estou fazendo backup de tudo no terminal. Eu não tenho uma pasta /media/windows .
/host parece conter todos os meus documentos do windows e tudo mais.
Como você não especifica como está fazendo backup, é difícil dizer, mas supondo que esteja usando o tar, então sim, apenas adicione --exclude = / host ou, melhor ainda, use --one-file -sistema para evitar que recorra a outros pontos de montagem.