Veja em /boot/grub/menu.lst, há um exemplo de configuração com o Windows na primeira partição do primeiro disco (hd0,0)
e no Linux na primeira partição do segundo disco (hd0,1)
. Além disso, você vê as entradas ativas. Se o windows estiver na primeira partição, sua parte ativa deverá ser semelhante a esta:
title Windows 7
root (hd0,0)
chainloader +1
title Debian Linux Default
...
(Não modifique a entrada do Linux)
Com o próximo boot, ele deve aparecer no menu de inicialização.