"Não sei", mas duvido.
Você deve ler /etc/init.d/postgresql
para ver o que realmente faz.
Não tenho certeza sobre a "melhor prática", mas presumo que a maioria das opções que você pode fornecer na linha de comando pode ser definida no arquivo de configuração do postgresql.
Se você conseguir especificar essas opções no arquivo de configuração, sugiro que faça isso , em vez de modificar /etc/init.d/postgresql
.