Basta criar um estilo personalizado para os títulos do anexo e definir uma numeração separada para esses títulos. Dessa forma, você pode numerar esses cabeçalhos independentemente dos títulos "principais".
Para obter esses cabeçalhos personalizados no TOC, você terá que selecionar esse estilo manualmente nas opções do TOC: Apósaseleçãode"Estilos adicionais", você pode selecionar o estilo de títulos de anexo em uma lista de estilos.