Não é uma resposta direta, mas uma que provavelmente funcionará é criar um disco ao vivo / instalador com remastersys - no seu caso provavelmente com a opção de backup completo do sistema, pegue o ISO que gera e use isso para fazer uma instalação 'nova' na sua VM.
Isso deve garantir que o software, as configurações, os usuários e os arquivos sejam movidos, além de instalar qualquer HW adicional necessário, além de outras coisas.