Existem muitas soluções para este problema. Os dois mais fáceis que vêm à mente ...
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Tenha uma terceira cópia de tudo no seu Mac. Mais backups nunca doem. Execute uma operação de rsync via script sempre conectando a qualquer ambiente. Isso pode exigir a compra de uma unidade adicional.
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Encontre uma solução de backup que atenda às suas necessidades. Idealmente, será capaz de realizar backups e diferenciais completos. Primeiro você precisa garantir que ambas as unidades sejam idênticas , a maneira mais fácil é colocar o disco rígido da sua casa no trabalho um dia e colocá-las em sincronia. Quando estiverem sincronizados, faça um backup completo com o software de qualquer uma das unidades. Você pode então realizar diferenciais para obter as alterações delta desde o último backup completo e restaurar no outro local. Uma vez feito o trabalho no outro local, execute outro backup diferencial em comparação ao seu último backup completo.
Outras soluções incluem sincronização com serviços de armazenamento de arquivos on-line, mas isso pode não ser realista se você tiver um limite de largura de banda pequeno. Não tenho conhecimento de nenhuma solução de software específica que seja adaptada à sua situação, no entanto, sistemas de backup diferenciais cuidam disso com facilidade.