A Apple tem uma página inteira dedicada a fazer o "Switch" do Windows para o Mac. Parte disso trata de como configurar o Boot Camp.
Switch 101: Migre seus arquivos ou sistema do Windows para o seu Mac
A Microsoft também tem uma página que descreve como mover o Windows para uma nova máquina. Essa nova "máquina" poderia ser apenas uma partição do Boot Camp:
Como mover uma instalação do Windows para um hardware diferente
Boa sorte!