Ok, nada que eu tentei funcionou neste momento e não há nada lá fora que eu possa ver no Google Earth. Então eu recuperei os dados inicializando de um live cd do Knoppix (ele não inicializava de um usb, então eu pedia emprestado e drive de cd externo) e usando o scp para copiar os arquivos para outra máquina. Então foi um caso de instalar uma nova cópia do Ubuntu 10.04 NBR na máquina e copiar os arquivos de volta. Ainda não sei ao certo o que causou o problema ou como consertá-lo, caso isso aconteça novamente.