Você está falando sobre os novos recursos de visualização do Aero? Onde, quando você passa o mouse sobre um ícone, ele mostra uma prévia? Você pode controlar isso modificando o registro. A localização que detém este controle é:
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced
A DWORD "ExtendedUIHoverTime" é o tempo em milissegundos de espera quando uma focalização de mouse é detectada para mostrar a visualização Aero ( fonte ).
O problema com os dispositivos de entrada é que todos eles detectam como um ponteiro do mouse. O Windows não diferencia entre um touchpad e um mouse físico. A única maneira que eu posso pensar para mudar o comportamento quando você conecta um mouse é criar um script que alterna o valor do registro. É uma maneira desajeitada de fazer isso e acho que seria melhor comprometer em um momento que se encaixa em ambas as situações.
Espero que isso ajude