Eu escrevi um programa em Java para percorrer as pastas e descompactar os arquivos. A árvore de pastas seria criada no destino, conforme necessário.
Infelizmente, SyncBack não fez backup de tudo. Muitos dos dados da minha esposa estão em arquivos zip de comprimento zero. Além disso, o SyncBack não trata os atalhos corretamente.