Eu estou supondo um pouco aqui, mas ...
O Ubuntu baixa os pacotes que está instalando em / var / cache / apt / archives
Você pode mover o diretório para o disco rígido interno e criar um link para esse diretório.
Isso deve funcionar.
Uma nova instalação do Ubuntu é de 2,7 GB. Eu movo meus dados para o disco interno e os 1 GB restantes devem durar um tempo razoável antes de ficar sem espaço. O Ubuntu deve limpar depois de si mesmo, e se livrar do download quando o pacote for instalado, então serão programas adicionais que causam problemas, não atualizações.