Hm, é difícil ajudar sem realmente depurar seu kernel, mas se a configuração nolapic
corrigir, há uma alta probabilidade de que o problema esteja relacionado ao APIC: -).
Então, seria algum tipo de problema (ou incompatibilidade) com o BIOS / mobo, então você pode não ser capaz de fazer nada sobre isso. Além disso, definindo nolapic não deve desativar completamente o segundo núcleo, ele só muda o roteamento IQ. Você verificou que o segundo núcleo está realmente desativado?
Se você quiser depurar isso mais:
Encontre o script de inicialização que executa o fsck no Ubuntu (no Debian é, deve ser similar no Ubuntu), então coloque um pouco de echo
s para restringir o local onde ele está travado. Além disso, forneça a opção "-V" para fsck para saída mais detalhada. Então veja para onde ir a partir daí.
Boa sorte ...