O gerenciador de boot Grub é bastante seguro para ser usado.
Configurar a inicialização para VHD no Windows 7 é muito fácil, por isso, mesmo que "estrague", não será difícil configurá-la novamente. Seguindo as etapas do blog do Scott Hanselman , você está pronto.
Minha configuração atual é, Windows 7 RTM, com um Win 7 VHD adicional, além de ser uma instalação do Ubuntu, seu gerenciador de inicialização não tem nenhum impacto na lista de inicialização do Windows.
Uma vez que eu selecione "Windows 7" em "Outros sistemas operacionais:" no gerenciador de inicialização do grub, são apresentadas as minhas duas opções de inicialização do Windows 7.