Geralmente, você instalará bibliotecas para instalação quando instalar um aplicativo que precise delas. Além disso, se uma nova versão de um programa precisar de bibliotecas que antes eram desnecessárias, elas serão instaladas automaticamente.
Se você está curioso sobre o motivo pelo qual uma biblioteca está sendo instalada, pode ver a lista de programas que requerem essa biblioteca. Além disso, você pode marcar uma biblioteca para ser removida e será solicitada a lista de aplicativos que também precisariam ser desinstalados, pois dependem dessa biblioteca. Em relação às versões antigas do kernel, é seguro marcar todos os kernels não utilizados para remoção (desde que aquele que você não remove realmente inicialize).