driveimage-xml criará uma imagem e, em seguida, permitirá que você navegue pelos arquivos através do novo sistema operacional. Eu sei que você pode extrair arquivos e pastas (como em documentos), mas não tenho certeza se ele pode extrair um aplicativo ou uma pasta inteira "Arquivos de programas" para instalar. Vale a pena tentar?
Tutorial (que não menciona a restauração de aplicativos) em lifehacker