AllowOverride None agora é o padrão para o Apache 2.4, portanto, é necessário permitir explicitamente substituições se você planeja usar .htaccess arquivos. Se você pretende usar mod_rewrite ou outras configurações em .htaccess arquivos, é possível permitir quais diretivas declaradas nesse arquivo podem substituir a configuração do servidor. Após as atualizações, AllowOverride None foi adicionado ao meu arquivo apache2.conf , que eu ignorei completamente. Depois que eu eliminei todas as diretivas em apache2.conf , os sites estavam de volta.