Se você quiser desligar completamente o sistema, sem atrasos / avisos, será necessário usar o sinalizador -f para um desligamento forçado, isso interromperá todos os programas que estão sendo usados no modo de administração e interromperá todos os serviços. Se você pode tentar mudar esse script, então
altere o comando de desligamento para
shutdown /f /s /t 0