Tenha o mesmo problema, o Android Studio abre todos os projetos abertos quando eu saí!
Metade de uma resposta está presente em desmarque a abertura automática ao iniciar o AS nas configurações do AS
Portanto, sem a abertura automática do projeto, o Android Studio é lançado com uma interface do usuário 'ruim', janela de inicialização do Android Studio ruim, mas fornecendo uma lista de seleção de projetos recente à esquerda da janela ;-), basta clicar no projeto desejado. vai!
Usando a primeira parte acima (desmarque a abertura automática) e no Windows (Win7 para mim), crie um atalho visando o aplicativo Android Studio; abra as propriedades do atalho e adicione o caminho do .idea\workspace.xml
do seu projeto à linha de comando. C:\Android\android-studio\bin\studio64.exe D:-Android\minimalistApp\.idea\workspace.xml
fecha com o botão OK para validar as alterações!
Agora, quando você clica nesse atalho, o Android Studio é iniciado em duas etapas: a interface do usuário mínima e o projeto será iniciado.
É claro, você pode criar quantos atalhos diferentes quiser segmentar projetos diferentes!