Um ótimo utilitário disponível gratuitamente e que você pode usar é o Clonezilla . É basicamente uma distribuição GNU / Linux muito simplificada que é inicializada a partir de mídia removível como USB ou CD, e possui todas as ferramentas necessárias para clonar e / ou redimensionar corretamente um disco ou partição. Você pode seguir este guia para clonagem disco-a-disco de um disco menor para um maior. O guia contém uma nota sobre o redimensionamento da partição copiada para que ocupe todo o espaço em disco disponível, se é isso que você procura.
Este método copia seu MBR, qualquer sinalizador de inicialização e a tabela de partições, portanto a segunda unidade deve estar pronta.