Eu tenho o mesmo problema aqui e ele não parece estar bem catalogado na internet! Em geral, parece que os Macs têm uma confiabilidade de lixo nos conectores de fone de ouvido e agora esse bug também! Não admira que eles querem eliminar o porto completamente!
Solução: um sono e um despertador manuais parecem corrigir o problema de som para mim. Agora, desativei o modo de suspensão automática nas Preferências do Sistema, pois é um buggy.
P.S. Isso parece ser um bug de hardware, pois afeta o El Capitan e o Mountain Lion pelo menos.