Se um disco está girando a uma taxa constante, e não haveria outras partes móveis nele, ele não vai vibrar muito. Mas o equilíbrio "perfeito" não existe, há SEMPRE um pouco de desequilíbrio, quão pequeno pode ser. Os discos diminuem a velocidade e aceleram, e é essa aceleração e desaceleração que faz com que os discos também vibrem. Há também o fato de que seus cabeçotes de leitura / escrita estão se movendo em velocidades muito rápidas. Toda vez que eles se movem para ler diferentes áreas do disco, eles causam uma leve vibração.
É tudo simples física e compreensão de que "perfeito" não existe no mundo real, apenas no mundo teórico. Quanto mais pesados forem os componentes dos objetos em movimento, mais difícil será esconder a vibração através de seus movimentos. E um disco tem muitas partes móveis, algumas são bem pesadas.