O que você está procurando é um recurso em seu software de backup chamado expansão de unidade. Um software que faz isso é chamado Acron é: True Image.
A grande maioria dos softwares de backup de estações de trabalho é projetada para funcionar com alguma unidade removível ou, ainda mais comumente, com um repositório web que carrega (carbonite, mozy ...). ) software de backup de estação de trabalho (daí a terrível qualidade do site).