A menos que eu esteja sentindo falta de algo, você poderia usar o EFS .....
Você pode obter e-mails em uma pasta e criptografar usando o EFS (lembre-se de fazer o backup do certificado)
Totalmente criptografada, que eu saiba que é a única outra opção que você tem que criptografar toda a unidade com o BitLocker ou algo assim.