Aviso sobre atualizações após a instalação das ferramentas do Kali linux
A página da web LionSec Katoolin GitHub alerta claramente os usuários de Katoolin a terem cuidado ao atualizar o software.
Antes de atualizar seu sistema, remova todos os repositórios Kali-linux para evitar qualquer tipo de problema.
Todos os tipos de problemas podem ocorrer se você não fizer isso.
Referência adicional: Como instalar ferramentas do Kali linux no Ubuntu 15.10
Os repositórios do kali são necessários?
O Katoolin é um script que torna rápido e fácil a instalação de ferramentas Kali linux ao mesmo tempo, no entanto, a adição de repositórios Kali nem sempre é necessária . Por exemplo, leia esta resposta a uma pergunta sobre como instalar apenas duas ferramentas do Kali linux, que também podem ser facilmente instaladas sem adicionar os repositórios do Kali.
Adicionar apenas as ferramentas do Kali Linux que você precisa manualmente é um bom treinamento que ensina a usar as outras ferramentas de gerenciamento de pacotes fornecidas pelos repositórios padrão do Ubuntu e que são mais seguras do que o Katoolin, porque não adicionam uma lista longa de repositórios adicionais para suas fontes de software.
Se você precisar instalar muitas ferramentas do Kali Linux, você deve considerar instalar o próprio Kali Linux, seja como um dual boot ou em uma máquina virtual. Se você fez o que parece ser um dano irreparável ao seu sistema com o Katoolin, eu recomendo que você remova todos os repositórios do Kali linux que você adicionou de suas fontes de software e com a ajuda do comando terminal history
remova todos os pacotes que você instalou com Katoolin, e começar de novo com baunilha Ubuntu. Você certamente deve tentar isso antes de desistir e reinstalar o Ubuntu.