Embora a gravação não seja muito clara, suspeito que o problema esteja nas cabeças de leitura / gravação estacionando com freqüência quando o disco está ocioso. A maioria dos drives modernos suporta um recurso chamado Advanced Power Management e, quando ativado, pode fazer com que os cabeçotes sejam retraídos quando possível, a fim de economizar energia e reduzir as chances de os pratos serem danificados se o computador for derrubado ou sofrer problemas de energia. É mais útil em laptops do que em desktops.
Observando os dados SMART, mostra que a contagem de carga é 18880 após 628 horas de uso, o que equivale a cabeças estacionando / não estacionando, em média, cerca de 30 vezes por hora. Isso seria consistente com a habilitação do APM.
Você pode testar se o APM realmente está causando os ruídos, desabilitando-o. Existe uma ferramenta chamada hdparm que pode fazer isso, mas tenha em mente que o efeito é apenas temporário e ativado se você reiniciar o PC. Uma vez instalado, ele deve aparecer no menu Iniciar com atalhos para alterar o modo APM.
É possível que você tenha alguma ferramenta como a Intel Rapid Storage Technology instalada que está habilitando o APM. Além disso, certifique-se de que seu plano de energia do Windows seja baseado em alto desempenho.