Normalmente, você pode excluir arquivos temporários e não perderá nada. Existem alguns casos marginais em que arquivos temporários podem ser valiosos, por exemplo, se você teve um corte de energia e um dos seus programas salvou seus dados em um arquivo temporário, mas não salvou antes que a energia fosse cortada. Nesse caso, você poderia ir para a pasta temp e tentar encontrá-la lá. Eu nunca tive isso acontecer, é teórico. Os processos do Windows também criam arquivos temporários e o Windows pode bloqueá-los porque os processos ainda estão em execução no momento em que você está tentando excluí-los. Sim, você pode excluir arquivos temporários manualmente, mas alguns ainda podem estar bloqueados e você não poderá. Muitos processos "esquecem" de limpar seus arquivos temporários, e é por isso que programas como o CCleaner removem automaticamente o lixo. Para poder excluir o máximo possível de arquivos bloqueados, vá até o gerenciador de tarefas e finalize todos os processos possíveis e, em seguida, execute o CCleaner. Você pode nunca excluir todos porque alguns podem ser usados pelo SO.