Se o seu HDD é um drive padrão SATA de 3,5 "e você deseja conectá-lo permanentemente, a maior dúvida é por que você deseja usar a conexão USB?
Na prática, o USB2 maximiza a velocidade de barramento de 35MB / s, quando o SATA oferece velocidade de barramento de 280 (SATAII) ou 550 MB / s (SATAIII). O HDD típico pode ler / gravar em 100-150 MB / s. Em outras palavras, ao conectar-se ao USB2, você cria um gargalo artificial no cabo USB e reduz o desempenho por fator 3x-5x. Ao conectar-se ao SATA (mesmo SATAII), você obtém o máximo desempenho possível de qualquer HDD (e muito mais do SSD).
Se você usasse o USB3, ele mudaria a equação, mas ainda assim, é muito mais seguro colocar sua unidade permanente dentro do seu computador permanentemente , e também usando mais confiável conexão de energia SATA dedicada.