Eles são coisas semelhantes, mas enquanto um link é apenas isso, um link para um arquivo ou pasta, um atalho pode conter mais informações, como parâmetros de lançamento, ícones personalizados, etc. Para criar um link simbólico, você só precisa fazer em um terminal:
ln -s /path/to/file /path/to/symboliclink
Para criar atalhos com opções personalizadas, existe um programa chamado arronax:
sudo apt-get install arronax
Você pode criar atalhos, salve onde quiser (geralmente na área de trabalho ou em $ HOME / .local / share / applications se quiser que eles apareçam no painel de unidades), defina ícones, defina se você deseja executar o programa em um terminal ou não ... etc.
Veja um exemplo:
Espero que ajude!