O Keepass não criptografa arquivos ou pastas, é simplesmente uma ferramenta para manter suas senhas seguras e organizadas.
Se você instalou um programa que bloqueou e / ou criptografou seus arquivos, uma solução realmente depende do programa que você usou.
Se simplesmente alterou as permissões NTFS ou similares, é uma tarefa trivial. Se no entanto você usou algo como True Crypt, você poderia ter configurado a criptografia completa e você precisará de suas chaves para desbloquear.
Em qualquer situação, o melhor caso é baixar novamente a ferramenta original e tentar desfazer as alterações feitas por você.
Se isso não for possível, precisamos de mais informações para ajudá-lo, como o nome do programa que você usou e / ou o que você fez.