Isso não pode ser feito. Um arquivo executável não pode ser incorporado em um arquivo PDF. Isso permitiria que vírus, cavalos de tróia, backdoors, rootkits, etc. invadissem máquinas. Seria o maior buraco de segurança possível.
Para fins de argumentação, digamos que você possa fazer isso (e você definitivamente não pode ) .EXEs só seriam executados em máquinas Windows (e nem todas as máquinas Windows poderiam executá-las) . Não funcionaria em Macs, Linux, Unix ou qualquer outro SO. Além disso, ninguém em sã consciência usaria um PDF com medo de infectar sua máquina.
Em uma nota lateral, os PDFs bloqueados podem ser facilmente quebrados. Além disso, há sempre uma maneira de fazer uma captura de tela, como capturar o buffer de tela, por exemplo. Mesmo se você puder impedir uma captura de tela, tudo o que teria que fazer é executar o programa em uma VM e capturar a tela do host. Simplificando, não importa que tipo de arquivo ou formas de proteção estejam em vigor, os dados podem ser copiados. Se os dados puderem ser visualizados por alguém, os dados serão copiáveis.