Adicione isto ao Find What (na caixa Substituir). Altere o número (6) para o número de caracteres adquiridos!
^(.{6})
E substitua por
$1-
para inserir o traço. Você poderia fazer $1a
para inserir o caractere a
Depois
Como insiro um caractere em uma string em uma determinada posição no Notepad ++?
Por exemplo
00000000 a 000000-00