Se o computador contiver hardware que exija que um driver funcione adequadamente, especialmente um controlador de disco rígido ou algo que habilite recursos de desempenho específicos da plataforma, sim, um sistema operacional específico (que contém os drivers necessários) pode trabalhe melhor nesse hardware do que em outros sistemas operacionais.
Voltar cerca de 10 anos atrás, quando as arquiteturas dos processadores estavam mudando e Northbridge / Os combos de Southbridge eram bastante comuns e tínhamos o que era conhecido como" drivers de chipset ", que na verdade eram quase obrigatórios para serem instalados em um computador primeiro item após a instalação do Windows, porque eles habilitaram (agora padrão) opções como UDMA para o controlador de disco rígido (em vez de muito mais lento e intensivo em CPU PIO ) que foi um aumento imediato de desempenho. O também tendia a conter correções que faziam o hardware se comportar melhor e corrigiam alguns bugs.
Hoje em dia, muito mais desse tipo de coisa é integrado ao Windows por padrão, com a Microsoft desempenhando um papel mais ativo para evitar que esses drivers sejam necessários.
É bem possível que o Ubuntu não tenha algum driver que seja necessário para ativar os recursos de desempenho em sua máquina, ou até mesmo esteja usando um driver "não ideal" que poderia estar diminuindo a velocidade.
Se o fabricante do hardware previu apenas executar o Windows nele, pode ser que ele tenha uma parte de hardware com a qual o Windows saiba como lidar, mas ainda não tenha sido escrito um driver para o Linux.