O que o programa Disk Management do Windows (digite diskmgmt.msc em um prompt de comando) mostra para esta unidade?
O tamanho de 200 MiB parece-me como se você pudesse ter formatado o seu drive USB com GPT particionamento em vez de MBR . Nesse caso, o OS X pode ter colocado uma "partição EFI" de 200 MB à frente de sua partição FAT. Se Disk Management mostrar que a unidade USB usa o particionamento GPT e houver duas partições, uma partição de 200 MiB seguida por uma partição FAT de 3,614 MiB (3,53 GiB), foi o que aconteceu.
Se esse for o problema, sugiro usar o particionamento MBR ao formatar em um Mac. Usando o Utilitário de Disco antes de aplicar o particionamento, clique no botão "Opções" (abaixo do gráfico "Esquema de Volume" à direita dos botões "+" & "-") e selecione "Registro Mestre de Inicialização".