Se a unidade não estiver aparecendo no explorador, provavelmente porque não está formatada em um formato reconhecido pelo Windows. Você pode abrir o console de Gerenciamento de Disco executando diskmgmt.msc na caixa de diálogo de execução. Você deve então ver o seu novo disco lá. Você pode criar uma nova partição e formatá-la como quiser.
Como alternativa, se você gostar da linha de comando, poderá usar o utilitário diskpart.exe.