// EDIT // Alterado devido a edições (juro que isso mudou enquanto eu estava digitando)
Uma solução suja é editar o grub.cfg, mas isso precisaria acontecer toda vez que uma atualização do kernel acontecesse.
No grub v2: (NOTA ISSO NÃO É RECOMENDADO)
vim /boot/grub/grub.cfg
A maneira correta de conseguir isso é editar o /etc/grub.d/30_os-prober (como você mencionou) e dizer para ignorar certas partições, um bom guia pode ser encontrado aqui
A solução suja # 2 poderia ser executar um script que comente essa linha do grub.cfg para o seu amigo.