Depende do que você está usando o cabo. Se você está usando para qualquer sabor de Ethernet (10/100 / 1000BASE-T), então sim, faz a diferença para a integridade do sinal.
A Ethernet usa sinalização diferencial, onde uma forma de onda de sinal é enviada para baixo de um fio de cada par, e o inverso desse sinal é enviado para o outro fio desse par. Como os dois fios do par são mantidos tão próximos pela torção, cada fio é igualmente exposto a qualquer interferência. No receptor, o sinal inverso (com interferência) é invertido novamente e combinado com o sinal normal (com interferência) do outro fio. Isso faz com que a interferência seja cancelada, enquanto o sinal é reforçado.
Se você não acertar os pares torcidos, os fios serão expostos a diferentes níveis de interferência, então o cancelamento não funcionará tão bem. Isso pode fazer a diferença em execuções mais longas em ambientes mais propensos à interferência (muitos outros cabos e equipamentos elétricos / eletrônicos) e em velocidades mais altas.
As pessoas fazem perguntas aqui o tempo todo sobre o motivo pelo qual a sua longa Ethernet gigabit não está funcionando, e a solução é que eles acertaram na pinagem, mas não conseguiram acertar os pares trançados.
Então, sim, verifique se os pinos 3 e 6 são um par trançado, etc.