Você ainda pode começar digitando / ou ~ e qualquer entrada antes disso será ignorada. Por exemplo. se o minibuffer contiver /home/foo//tmp/bar.txt , então /tmp/bar.txt será aberto.
Deve haver feedback visual para isso, mostrando a parte que será ignorada em uma cor mais escura. Verifique se file-name-shadow-mode é t (por padrão) e se a shadow face é consideravelmente diferente da default face. Eu descobri que tinha ativado um tema de cores que não distinguia realmente os dois, então eu digitei M-x customize-face RET shadow e fiz o texto mais escuro.
Parece que lembro que existe um modo que realmente exclui a parte da entrada que será ignorada, mas não consigo encontrá-la agora ...