Reinstalar o sistema operacional sem apagar deixará muitos tipos de software de terceiros (incluindo malware) no lugar. O que você quer fazer é inicializar a partir do DVD de instalação (10.6 ou anterior) ou do modo de recuperação (10.7 ou posterior) , execute o Utilitário de Disco (no menu Utilitários do DVD de instalação; na janela principal do modo Recuperação), apague o disco (certifique-se de formatá-lo no Mac OS Extended) e saia do Utilitário de Disco e execute o instalador instalar um sistema operacional completamente limpo.
Os aplicativos que a Apple fornece com o sistema operacional (como o Time Machine) serão reinstalados junto com todo o resto. Quanto aos aplicativos de terceiros, você precisará obter os discos do instalador do proprietário anterior ou recomprá-los. Para aplicativos da Mac App Store, eles são licenciados para uma ID da Apple, que geralmente fica com o proprietário anterior, então você terá que recomprá-los.