Resposta curta:
Sim, uma unidade flash USB3 conectada a uma porta USB3 certamente seria mais rápida que um disco rígido de 5400 RPM. Já executei o Windows-To-Go a partir de uma unidade flash antes e o desempenho está em paralelo com a inicialização do SSD interno.
NO ENTANTO ...
Você também gravará esse flash drive rapidamente. As máquinas virtuais são muito intensivas em E / S. Unidades flash USB não são projetadas para lidar com esse tipo de carga a longo prazo da mesma forma que os SSDs são.