Você pode estar interessado em inicialização dupla. Você pode ter um linux os em uma partição e mac os no outro. Swithing entre esses dois será muito fácil e você pode até mesmo remover o sistema operacional dual linux e só ter o mac os uma vez que estiver pronto.
Talvez essa pergunta aqui forneça mais informações sobre o dual boot linux e mac osx. Esta questão ou Esta pergunta é o que mais lhe convier.
Quanto às consequências que cito de um site .
If you’re thinking about reinstalling because something has gone wrong with your Mac, know that an OS X reinstallation should be your last resort. If nothing else fixes your Mac, reinstalling OS X could well be your final option before invasive surgery (that is, trundling your Mac to a repair shop). You don’t want to reinstall OS X if something easier can correct the problem. So if you have to do a reinstallation, realize that this is more or less your last hope (this side of the dreaded screwdriver, anyway).
Na pior das hipóteses, você terá que trazê-lo para o cuidado da maçã. Além disso, algumas coisas podem dar errado e os dados podem se perder (se você não fizer backup dele).