Este disco USB ... é um pen drive ou um disco rígido externo?
Se for uma unidade flash USB, o problema provavelmente é porque a unidade possui uma tabela de partições. O Windows não suporta várias partições em uma unidade flash.
Em um Mac, se você apagar uma unidade flash com o Utilitário de Disco, ela formatará a unidade com uma tabela de partição GUID por padrão e criará a partição EFI oculta, além da partição de dados normal.
Se este for o caso, a única maneira de resolver o problema seria fazer o backup dos dados, reformatar o pendrive USB com uma tabela de partição MBR e copiar os dados novamente. Você pode manter o HFS + se quiser. Lembre-se de que você ainda precisará de um utilitário de terceiros para acessá-lo no Windows.