Kernels até 4.8.46 parecem funcionar, o problema ocorre a partir de 4.8.49 e mais recente. O kernel 4.10 também é afetado. Isso ocorre devido à introdução do APST no driver nvme, que não funciona adequadamente com os SSDs Samsung PM951.
O parâmetro do kernel nvme_core.default_ps_max_latency_us=6000
desabilita o estado de economia de energia P4 e torna o sistema estável novamente.