Se o microfone USB2 específico não funcionar na porta USB 3.0, deve haver algum problema mais profundo no nível do sistema / driver.
Tecnicamente, não há necessidade de desativar o USB 3.0 para que um dispositivo USB2 funcione. Eletricamente falando, o USB2 legado funciona em paralelo com o novo USB3, através de um conjunto separado de fios legados (D +, D-, compartilhando GND e VBUS com USB3). Portanto, quando um dispositivo USB2 é conectado, a seção USB3 não terá conexão e nenhum efeito, e a comunicação deve prosseguir nos fios herdados.
No entanto, as portas USB3 estão sob o controle de um controlador diferente, xHCI, que também suporta operações USB2, mas com um novo driver xHCI. Se o software para o antigo dispositivo USB2 proprietário for gravado sem levar em conta a interface do aplicativo do dispositivo do driver do sistema e de alguma forma esperar um controlador antigo específico (EHCI), a simples desabilitação do controlador xHCI pode não ajudar.
BTW, desabilitar a funcionalidade USB3 é tão simples quanto ir ao Gerenciador de Dispositivos e configurar o Controlador do Host eXtensible (na seção USB) para "desativar".