Grande diferença.
A% systemdrive% (normalmente c :) é a partição com o diretório% systemroot% (normalmente, o Windows).
% homedrive% normalmente é o diretório de perfil raiz da sua rede, em um domínio (Active Directory), ele residiria em um servidor.
Os links da Web para suas descrições expandidas são ricos e volumosos. Você pode encontrar mais informações sobre eles em Microsoft.com .